本中心扮演對政府決策與施政研究的智庫角色，復又因處於南台灣(高雄市)，肩負平衡南北區域發展，以及為台灣南部地方及其政策發聲之使命，故中心現階段將以「平衡區域」和「接軌國際」作為中心的研究方針，並進行五大面向之專題研究，期對當前相關之政府決策規劃提供建言與倡議。在平衡區域的部分，將著重在「產業創新驅動」、「人口紅利再造」與「地方財政再生」等三個面向的研究。「產業創新驅動」研究，將著眼於探索綠色能源產業跨領域與跨區域的對接可行性，期望發揮南部能源產業的新能量。「人口紅利再造」研究，著重於紓解人口結構變遷對高齡化社會的影響，將致力於研究「多元長照」的發展，以達到人口紅利再造的效果。在「地方財政再生」研究面向，將探究如何活絡地方經濟，以紓解近年來日益嚴重的地方財政缺口。至於接軌國際的部分，將側重在「港灣都市轉型」與「比較優勢創造」兩項研究。「港灣都市轉型」計畫將分析高雄港如何從貨櫃中心轉型為工業的物流園區，進而成為「東北亞與東南亞的經濟樞紐」。「比較優勢創造」計畫，則是以臺灣產業發展為核心思考，盤點台灣的產經優勢，期望能南向與東南亞區域進行互補性的整合。